在《孤岛危机2》的危机故事叙述中会不时的闪现一些一代的镜头，如果大家没玩过《孤岛危机》的揭晓局谜话，也许你会觉得迷茫，代结所以对剧情好奇的孤岛玩家还要专门去玩一次《孤岛危机》。对于玩过的危机陈索斌玩家，自然会发现一些谜团的揭晓局谜秘密，他们为什么去朝鲜的代结岛屿。（半剧透：比如一代中队长独自返回外星人基地，孤岛他到底怎样了？危机其实背后有一个更大阴谋，纳米战士其实都被高层所蒙蔽。揭晓局谜）
一代的剧情很顺很简单，就是一个硬性、明确的任务的剧情，但《孤岛危机2》的剧情则非常有趣，这一切都不是那么简单的一场抵御外星人的战斗。
